Подбор подвижной фазы (системы) проводится по следующим правилам:

Выбирают такую систему, в которой разделяемые компоненты имеют небольшую растворимость (если растворимость вещества высокая, то вещества будут перемещаться с фронтом, при низкой растворимости - оставаться на старте). При распределительной хроматографии или при использовании обращенных фаз, растворимость веществ должна быть выше в подвижной фазе, чем в неподвижной.

Состав системы должен быть постоянным и легко воспроизводимым.

Растворитель или компоненты системы не должны быть ядовитыми или дефицитными.

Система должна полностью разделять вещества близкого строения, причем различия в R_f должно быть не менее 0,05.

Система не должна вызывать химические изменения разделяемых компонентов.

В выбранной системе анализируемые вещества должны иметь различные значения R_f и распределяться по всей длине хроматограммы. Желательно, чтобы значения R_f лежало в пределах 0,05-0,85.

При выборе системы также необходимо учитывать природу разделяемых веществ. Так, при хроматографировании веществ, имеющих основные свойства система не должна обладать кислотными свойствами и наоборот.

Эти рекомендации дают предварительную оценку выбранной системы. Последнее слово все равно остается за экспериментом. [3]